蛋白實驗檢測常見問題及解答
問題1:為什么選擇內參?
內參也叫看家基因,在組織或細胞中都會表達,且表達量在不同組織或細胞中幾乎是相同的,一般有α-Tublin,β-actin,GAPDH等,在WesternBlotting中使用內參其實就是在WB過程中的另外用內參對應的抗體檢測內參。其作用有二:
1.是看提取蛋白質量的好壞。如果做western的時候,內參照蛋白有條帶,而目的蛋白沒有,說明蛋白的提取和轉膜等步驟沒有問題,是目的蛋白的抗體質量不好或者是稀釋倍數不對。
2.是比較客觀的說明目的蛋白的表達情況,消除上樣量等的誤差。不同的樣品之間由于蛋白提取的量有差別,可能強陽性的表達跑出來的帶很弱。因此設立內參照,比較不同樣品之間的表達情況。
問題2:為什么檢測的背景比較高?
1.可能抗體濃度濃度較高。
2.抗原量較大。
3.一張膜中有的目的條帶較弱,為了能讓較弱條帶顯示出來,曝光時間較長。
問題3:為什么檢測無信號?(白板)
大概總結為以下幾類原因:
1.樣品中目的蛋白豐度很低,低于實驗的檢測下限。
3.蛋白降解。
4.待測樣品的確為陰性。
5.一抗失效。
6.抗原量不足,每泳道蛋白上樣量不低于0.1ug。
問題4:為什么檢測的結果分子量大小與實際不符?
1.翻譯后修飾-比如蛋白的磷酸化,糖基化等,這些都會增加蛋白的分子量大小。
2.翻譯后剪切-比如很多蛋白首先被合成為前體形式,然后通過剪切獲得生物學活性。
3.剪切變異體-相同的基因,經過選擇性剪接會產生不同分子量大小的蛋白。
4.相對電荷-氨基酸的組成(帶電vs不帶電)。
5.多聚體-比如蛋白二聚體。